- Central Nacional de Anilhagem (CEMPA)
- Monitorização de Aves Aquáticas
- Genética da Conservação
- Veterinária e Saúde Pública
- Cegonha-preta
- Cegonha-branca
- Águia-imperial
- Lobo-ibérico
- Morcegos
- Gato-bravo
- Projectos LIFE Natureza
- Espécies não indígenas
- Novo Atlas das Aves que nidificam em Portugal
- Plano Nacional de Conservação da Herpetofauna e Atlas dos Anfíbios e Répteis de Portugal Continental
- POA - Programa Operacional de Ambiente
- Impacto das linhas eléctricas na avifauna:
• Protocolo de colaboração entre o ex-ICN e a Rede Eléctrica Nacional; e
• Monitorização e minimização dos impactes resultantes da interacção entre as linhas de alta e média tensão e a avifauna
- INSPECT - (2009 - 2011)
Espécies exóticas marinhas introduzidas em estuários e zonas costeiras portuguesas
- "Intervenção Saramugo 2008"
Parque Natural do Vale do Guadiana
- “Plano de Monitorização da Ictiofauna”
Parque Natural do Vale do Guadiana
- Caracterização da População de Águia Real (Aquila chrysaetos) no Parque Natural do Douro Internacional e ZPE do Vale do Côa
- Impacto da Implementação de Medidas de Gestão do Habitat nas Populações de Coelho-bravo no Parque Natural do Sudoeste Alentejano e Costa Vicentina.
- Morcegos e Aves das Florestas de Cantanhez e Cacine (Guiné-Bissau 2007)
- Protecção e Gestão de Abrigos Subterrâneos - Morcegos (EUROBATS)